中医药古籍版本资源库是中国中医科学院中医院信息研究所/图书馆自主研发的一款专业数据库，按照全面覆盖、门类齐全、突出重点、体现特色的原则，囊括《中国中医古籍总目》（2007年版）全部数据，归纳版本特点，总结核心知识，制定版本索引规范与鉴定依据，集中医药古籍版本信息检索、对比、鉴定以及书目款识知识服务于一体，可以满足读者对于古籍版本研究的全面需求，已向公众免费开放。

本数据库作为“国家古籍工作规划项目”之一，对接“国家版本资源库”大数据体系，服务于国家古籍工作重大需求，被全国古籍整理出版规划领导小组列入《2021-2035年国家古籍工作规划》重大工程内容。2024年，数据库作为版本目录馆，被“国家中医药古籍和传统只是数字图书馆”收录。

为贯彻中共中央国务院《关于促进中医药传承创新发展的意见》《中医药发展战略规划纲要（2016-2030）》《“十四五”中医药发展规划等文件精神，本数据库率先倡导兄弟院校加入研究，聚合优质中医药古籍资源，完善古籍版本信息。为中医药古籍定级提供支撑，促进总目修订与完善；推动古籍提要与海外存藏古籍目录编纂，整理出版重点馆藏古籍书目。构建古籍内容生产与知识服务数字化平台，提供古籍版本鉴定和古籍知识服务。

2023年，中国国家版本馆（国家版本数据中心）为完成赓续中华文脉、坚定文化自信、展示大国形象、推动文明对话的重要使命，号召全国图书馆、博物馆等单位为国家版本资源总库和中华文化种子基因库留存古籍血脉，我馆作为中医药古籍专业藏馆积极响应国家号召，参与到此项目中，将之命名为“二二工程”，并将已完成深度普查、留存文化种子的古籍在本数据库中做出标识，警醒后世中医药文脉存续绵延的重要性。